Evropská vědecká komunita se stále více zaměřuje na otevřenost a opakované využití výzkumných dat. Klíčovým krokem na této cestě je uchovávání dat v jednotném formátu, což usnadňuje jejich sdílení. Tento princip platí i pro genomická data získaná v biomedicínském výzkumu. Česká republika se nyní zapojuje do tohoto evropského úsilí prostřednictvím nově vznikajícího úložiště na 1. lékařské fakultě Univerzity Karlovy, které vzniká ve spolupráci s Ústavem organické chemie a biochemie Akademie věd ČR. Toto úložiště umožní českým vědcům sdílet data v rámci celoevropské platformy FEGA (Federated European Genome-phenome Archive). Univerzita o tom dnes informovala v tiskové zprávě.
„Sdílení a opakované využití rozsáhlých genomických a s nimi souvisejících medicínských dat je zcela klíčovou podmínkou pro naše možnosti objasňovat podstatu a příčiny vzácných nebo multifaktoriálních genetických onemocnění a pro rozvoj personalizované medicíny,“ řekla Věra Franková z Ústavu humanitních studií 1. lékařské fakulty UK.
Nové úložiště bude fungovat nejen jako bezpečné místo pro uchovávání citlivých genomických dat, ale také jako datový uzel propojený s evropskou platformou FEGA. Tato federovaná síť umožňuje, aby lokálně uložená data neopouštěla místo svého vzniku, přičemž jsou zároveň dostupná pro další výzkumníky v jednotném formátu. „Takzvaný federovaný systém propojených uzlů poskytuje maximální bezpečnost a zároveň efektivní sdílení dat,“ vysvětluje Jiří Vondrášek z Ústavu organické chemie a biochemie AV ČR.
FEGA zpřístupňuje anonymizovaná genomická data pro specializované analýzy, což usnadňuje mezinárodní spolupráci. „Klíčové je, že FEGA respektuje etické standardy a právní předpisy jednotlivých zemí a zajišťuje, aby přístup k datům byl řízený, transparentní a maximálně bezpečný,“ zdůrazňuje Franková, která na 1. lékařské fakultě UK působí také jako etik pro Banku biologického materiálu.
Datový uzel budovaný na 1. lékařské fakultě UK se zaměřuje na vytvoření dostatečných kapacit pro sdílení citlivých genomických dat z českých výzkumných institucí, jako je Všeobecná fakultní nemocnice v Praze. „Zřízení datových uzlů umožní českým výzkumníkům přístup k rozsáhlé síti evropských datových zdrojů, čímž se významně podpoří interdisciplinární spolupráce a zapojení českých vědců do mezinárodních projektů,“ uvedl Zdeněk Kleibl z Ústavu lékařské biochemie a laboratorní diagnostiky 1. lékařské fakulty UK.
Mohlo by vás zajímat
Kromě technických výhod přispěje uzel FEGA k výměně znalostí a zkušeností mezi odborníky, čímž podpoří rozvoj zapojených institucí jako center špičkového výzkumu v oblasti genomiky a bioinformatiky. Tento krok tak představuje významný posun v otevřenosti české vědy a její integraci do evropského výzkumného prostoru.
